Эмне үчүн биз Sanger секвенирлөөсүн колдонобуз?
Эмне үчүн биз Sanger секвенирлөөсүн колдонобуз?

Video: Эмне үчүн биз Sanger секвенирлөөсүн колдонобуз?

Video: Эмне үчүн биз Sanger секвенирлөөсүн колдонобуз?
Video: ШЕБЕРЛЕР кандай жаралат!Димаш жана Сундет 2024, Ноябрь
Anonim

Сангер секвенциясы үлгүлөрдүн жалпы саны аз болгондо варианттык скринингдик изилдөөлөр үчүн эффективдүү ыкма болуп саналат. Үлгү саны жогору болгон варианттарды скринингдик изилдөөлөр үчүн, ампликон ырааттуулук NGS менен эффективдүү жана үнөмдүү.

Ошо сыяктуу эле, сиз Сэнгер секвенирлөөнүн максаты эмне деп сурасаңыз болот?

Сангер секвенциясы - in vitro ДНКнын репликациясынын жүрүшүндө чынжырды аяктоочу дидаеоксинуклеотиддердин ДНК полимеразасы тарабынан тандалып кошулуу процесси; бул SNVs аныктоо үчүн абдан көп колдонулган ыкмасы болуп саналат.

Ошондой эле билесизби, эмне үчүн ddNTPs Сангер секвенирлөөсүндө колдонулат? Дидеоксинуклеотиддер чынжырды узартуучу ингибиторлор болуп саналат ДНК полимераз, колдонулган ичинде Сангер үчүн ыкмасы ДНКнын ырааттуулугу . Ошентип, бул молекулалар дидеокси чынжырын токтотуу ыкмасынын негизин түзөт ДНКнын ырааттуулугу Фредерик билдирген Сангер жана анын бригадасы 1977-жылы мурдагы иш-тин уландысы катары.

Ошондой эле, эмне үчүн NGS Сангерге караганда жакшыраак?

Сангер секвенирование бир эле учурда бир фрагментти ырааттуулай алат. Анткени NGS миллиондогон ДНК бөлүктөрүн байланыштыра алган агым клеткаларын колдонот, NGS бир эле учурда бул тизмектердин баарын окуй алат. Бул жогорку өткөрүмдүүлүк өзгөчөлүгү ДНКнын чоң көлөмүн секвенирлөөдө аны абдан үнөмдүү кылат.

Sanger секвенирлөө үчүн сизге эмне керек?

үчүн ингредиенттер Сангер секвенциясы Аларга төмөнкүлөр кирет: А ДНК полимераз ферменти. Бир катарлуу кыска кесим болгон праймер ДНК бул шаблон менен байланыштырат ДНК жана полимераза үчүн "стартер" ролун аткарат. Төрт ДНК нуклеотиддер (dATP, dTTP, dCTP, dGTP)

Сунушталууда: