Сэнгер секвенциясы канчалык так?
Сэнгер секвенциясы канчалык так?

Video: Сэнгер секвенциясы канчалык так?

Video: Сэнгер секвенциясы канчалык так?
Video: 3 1 Основные понятия Секвенирование по Сэнгеру Basic concepts Sanger sequencing 2024, Май
Anonim

Сангер секвенциясы 99,99% менен тактык клиникалык изилдөө үчүн "алтын стандарт" болуп саналат ырааттуулук . Бирок, жаңы NGS технологиялары клиникалык изилдөө лабораторияларында кеңири жайылып баратат, анткени алардын өткөрүү жөндөмдүүлүгү жогору жана бир үлгү үчүн чыгымдар төмөн.

Ошондой эле, эмне үчүн NGS Сангерге караганда жакшыраак?

Сангер секвенирование бир эле учурда бир фрагментти ырааттуулай алат. Анткени NGS миллиондогон ДНК бөлүктөрүн байланыштыра алган агым клеткаларын колдонот, NGS бир эле учурда бул тизмектердин баарын окуй алат. Бул жогорку өткөрүмдүүлүк өзгөчөлүгү ДНКнын чоң көлөмүн секвенирлөөдө аны абдан үнөмдүү кылат.

Кошумчалай кетсек, Сэнгер секвенирлөөнүн мааниси эмнеде? Сангер секвенциясы - in vitro ДНКнын репликациясынын жүрүшүндө чынжырды аяктоочу дидаеоксинуклеотиддердин ДНК полимеразасы тарабынан тандалып кошулуу процесси; бул SNVs аныктоо үчүн абдан көп колдонулган ыкмасы болуп саналат.

Андан кийин, Сэнгер секвенирлөө менен кийинки муун секвенирлөөнүн ортосунда кандай айырма бар?

кийинки - муун ырааттуулугу (NGS) технологиялары окшош. сын Sanger секвенирлөөнүн ортосундагы айырма жана NGS болуп саналат ырааттуулук көлөмү Ал эми Сангер ыкмасы гана ырааттуулугу бир эле учурда бир ДНК фрагменти, NGS массалык параллелдүү, ырааттуулук бир эле учурда миллиондогон фрагменттерди иштетүү.

Чынжырды токтотуу секвенциясы кантип иштейт?

Sanger DNA ырааттуулук катары да белгилүү чынжыр - токтотуу ыкмасы ырааттуулук . ddNTPs алып келет токтотуу ddNTPs нуклеотиддердин ортосунда фосфодиэфир байланышын түзүү үчүн зарыл болгон 3'-OH тобу жок болгондуктан, ДНК тилкеси. Бул байланышсыз, чынжыр нуклеотиддердин пайда болушу токтотулду.

Сунушталууда: